Recherche d’agents de lutte biologique d’origine microbienne contre des champignons phytopathogènes

Foughalia, Abdelhamid (2022) Recherche d’agents de lutte biologique d’origine microbienne contre des champignons phytopathogènes. Doctoral thesis, Université Mohamed Khider de Biskra.

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Abstract

Les champignons phytopathogènes constituent la principale cause des maladies des plantes. Que ce soit en pré ou en post-récolte, ils sont à l’origine de plusieurs pertes annuelles à travers le monde. Les méthodes de lutte adoptées par les producteurs et les agriculteurs se basent en général sur le traitement chimique. Toutefois, à cause de leur effet sur l’environnement, la santé humaine et la biodiversité, une importance particulière a été apportée aux nouvelles méthodes de lutte alternatives dont la lutte biologique. Cette méthode de lutte commence à trouver sa place dans le domaine de la lutte contre les agents phytopathogènes. En effet, plusieurs agents de lutte biologique y compris ceux d’origine microbienne sont commercialisés et homologués à travers le monde. En revanche, en Algérie, la lutte biologique n’a pas encore trouvé sa place parmi les autres méthodes de lutte classiques (notamment la lutte chimique). C’est dans cette optique que s’inscrit notre travail qui a pour but de développer de nouveaux agents de lutte biologique d’origine microbienne contre des champignons phytopathogènes. Comme première partie de ce travail, 142 isolats bactéries ont été isolés (69 d’origine rhizosphériques (rhizosphère des tomates saines) et 73 non rhizosphériques). Après un premier test in vitro contre B. cinerea (BC1), 40 isolats (20 isolats rhizosphériques et 20 isolats non rhizosphériques) ont été sélectionnés pour évaluer leur effet contre trois souches de B. cinerea sur plantes et sur segments de tiges. Les résultats obtenus ont permis de sélectionner sept souches avec une efficacité significative (moyenne de protection >90%). Ces souches sélectionnées ont également montré un fort effet même à faibles concentration, notamment pour P. argentinensis SJ2 (IC50 égal à 9.104 UFC mL-1 et 8,8 .104 UFC mL-1 pour BC1 et BCJ2 respectivemen)t. Contre O. neolycopersici les sept souches sélectionnées ont pu protéger les plantes de tomate avec un pourcentage d’efficacité compris entre 33 % à 75 %. Pour l’effet contre M. scaettae et les autres champignons responsables de pourritures post-récolte, toutes les bactéries sélectionnées ont eu la capacité d’inhiber significativement la croissance des champignons cibles (M. scaettae, A. alternata, Bipolaris sp, G. candidum et P. digitatum). De même, parmi les sept bactéries retenues, cinq bactéries ont pu stimuler la croissance des parties aériennes des plantules de tomate. L’indice de vigueur est significativement augmenté en présence de quatre bactéries parmi les sept testées. Pour la deuxième partie de ce travail, deux bactéries rhizosphériques (Acinetobacter calcoaceticus SJ19 et Bacillus safensis SJ4) ont été testé contre B. cinerea (souche BC21). Les résultats obtenus ont révélé l’efficacité in planta de ces bactéries. L’application des deux bactéries 1 h avant l’inoculation du pathogène a mieux protéger les tomates par rapport aux autres traitements (simultané et 1h après l’inoculation du pathogène) suggérant que ces deux bactéries agissent par induction de mécanisme de résistance de la plante. Un effet synergique de SJ4 et SJ19 est également enregistré. Le potentiel de lutte biologique conféré par les souches sélectionnées (les sept souches de la première partie avec les deux souches de la deuxième partie de travail) semble important pour développer des biofongicides d’origine microbienne

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