Morphologie comparée et phylogéographie des barbeaux endémiques du Maghreb, particulièrement en Algérie

BRAHIMI, Amina (2018) Morphologie comparée et phylogéographie des barbeaux endémiques du Maghreb, particulièrement en Algérie. Doctoral thesis, Université Mohamed Kheider- Biskra.

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Abstract

Dans le Maghreb, les communautés de poissons indigènes (non introduits) sont dominées par les cyprinidés, essentiellement par des espèces de barbeaux endémiques. Certains sont sympatriques et d’autres sont exclusifs dans des habitats particuliers comme les Foggaras en Algérie. Ces espèces présentent des enjeux de conservation importants. Malheureusement, elles restent mal connues, en raison des difficultés pour leur identification : inexactitudes et erreurs qui jouent sur la fiabilité dans les études écologiques et, par conséquent, sur la gestion et la conservation de ces espèces. De ce fait, l’objectif principal de cette thèse est d’approfondir les connaissances fondamentales sur la diversité génétique et la structuration populationnelle, pour déterminer les ressources notamment par l’inventaire moléculaire des espèces et la cartographie de leur répartition. En outre, des considérations taxinomiques et systématiques ont été suggérées dans un contexte d’une approche multidisciplinaire, impliquant des données génétiques, morphologiques, ostéologiques, biologiques et écologiques. Pour comprendre l’histoire évolutive des barbeaux en Afrique du Nord, les relations phylogénétiques ont été étudiées à l’aide de deux marqueurs mitochondriaux (cytochrome b et la Dloop) sur un ensemble de 242 séquences d’ADNmt. D’après nos résultats, 22 espèces valides vivent au Maghreb, dont 19 espèces appartiennent au genre Luciobarbus (tétraploïdes) contre 3 espèces (hexaploïdes) -exclusivement endémiques au Maroc- appartiennent au genre Carasobarbus (2 espèces) et Labeobarbus (une seule espèce). Cette grande diversité génétique au sein du genre Luciobarbus due probablement à une radiation marquée de plusieurs lignées après la crise messénienne (≈ 5,5 millions d’années). En Algérie, la littérature scientifique sur les barbeaux, donne seulement cinq espèces : deux fréquentent les oueds sahariens (Luciobarbus biscarensis et Luciobarbus pallaryi) et trois vivent dans les oueds méditerranéens: Luciobarbus callensis, Luciobarbus leptopogon et Luciobarbus setivimensis. Cependant, grâce à l’analyse génétique et la révision systématique sur 518 spécimens de barbeaux du Maghreb, les résultats actuels montrent la présence de huit espèces dont six sont des lignées méditerranéennes allopatriques. Deux entre eux seront décrites pour la première fois au cours de cette thèse (Luciobarbus chelifensis nov. sp et Luciobarbus mascarensis nov. sp). Dans les régions sahariennes, les analyses génétiques, morphologiques, ostéologiques et biologiques, nous ont permis d’aborder la question de la survie des populations des barbeaux dans les milieux extrêmes, d’une part, et l’évaluation du rôle majeur des glaciations du Quaternaire dans la structuration de l’espace géographique et l’évolution de la diversité génétique d’autre part, en retraçant l’histoire démographique des deux populations isolé és appartenant à l’espèce L. pallaryi dans le bassin du Guir (Algérie). Finalement, une synthèse des différents résultats a permis d’explorer la problématique de conservation des barbeaux endémiques au Maghreb en général et en Algérie en particulier. Mots clés

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