Thème : Etude des microorganismes antagonistes (Trichoderma ssp.) du fusariose (Fusarium spp.), principale maladie fongique des cucurbitacées dans la région de Biskra.

FADLAOUI, Soumaia (2024) Thème : Etude des microorganismes antagonistes (Trichoderma ssp.) du fusariose (Fusarium spp.), principale maladie fongique des cucurbitacées dans la région de Biskra. Doctoral thesis, UNIVERSITE MOHAMED KHIDER - BISKRA.

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Abstract

La culture des cucurbitacées revêt une grande importance économique en Algérie, notamment dans la région de Biskra où elle contribue de manière substantielle à l'économie agricole locale et nationale. Cependant, cette filière est fragilisée par la fusariose causée par le champignon Fusarium spp. L'objectif de cette thèse est d'étudier ce phatogène afin d'identifier des agents de biocontrôle efficaces sous forme de souches antagonistes du genre Trichoderma, dans le but de proposer des solutions de lutte durable contre cette maladie. Un diagnostic de la situation a été réalisé via des enquêtes menées auprès de la DSA, du MADR, des agriculteurs et des grainetiers de la région afin d'analyser l'importance économique de la culture, la situation socio-économique des producteurs et l'état actuel de l'infection. Des échantillons de plantes malades et des sols ont ensuite été collectés dans différentes zones pour isoler les champignons présents (Fusarium et Trichoderma). Les souches fongiques isolées ont été caractérisées morphologiquement et identifiées moléculairement par amplification et séquençage de l'ITS et du gène TEF-1 suivi d'une analyse phylogénétique par la méthode UPGMA à l'aide du logiciel MEGA 11. Le pouvoir pathogène des isolats de Fusarium spp. et le pouvoir antagoniste des isolats de Trichoderma spp. ont été évalués en étudiant la vitesse de croissance mycélienne, le test de pathogénicité des Fusarium spp sur des grains de melon dans des boîtes de Petri et le test de confrontation directe des isolats de Trichoderma spp. contre différentes espèces de Fusarium. Vingt-cinq isolats de Fusarium et sept isolats de Trichoderma ont été isolés. Huit espèces de Fusarium spp et quatre espèces de Trichoderma spp. ont été identifiées. Les résultats ont montré que 16% des espèces de Fusarium étaient F. solani, 4% F. f. falciforme, 20% F. oxysporum, 28% F. equiseti, 12% F. nygamai, 8% F. prolifératum et 4% F. brachygibbosum. Les espèces de Trichoderma comprenaient deux isolats de T. virens, un isolat de T. harzianum, un isolat de T. asperellum et trois isolats de T. rifaii. Cette dernière est signalée pour la première fois en Algérie. Les résultats ont également montré la pathogénicité de certains isolats de Fusarium inhibant plus de 53% de la germination. Les espèces de Trichoderma ont démontré une grande efficacité en tant qu'agents de biocontrôle contre le Fusarium, avec un taux d'inhibition supérieur à 70%. Ce travail a permis de caractériser les Fusarium infectant les cucurbitacées dans la région de Biskra et de proposer des agents de biocontrôle prometteurs du genre Trichoderma sur la base de leurs performances in vitro. L'utilisation de souches sélectionnées de Trichoderma comme biopesticides ouvre des perspectives pour une lutte plus durable contre cette contrainte majeure

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